A Escola Básica Guerra Junqueiro de Freixo de Espada à Cinta, situado na vila sede do concelho, é a escola sede de Agrupamento, estando instalada em edifício ampliado e restaurado.
Esta escola é constituída por quatro blocos de salas ligados entre si por escadas e "hall" interiores. Nesta escola, funcionam os Serviços de Administração Escolar, serviço de reprografia e cantina escolar, onde são servidas as refeições diárias dos alunos do 1.º, 2.º e 3.º ciclos.
No Agrupamento de Escolas Guerra Junqueiro, os alunos usufruem de uma sala de informática equipada com computadores suficientes para a lecionação da disciplina de TIC, e todas as outras salas estão equipadas com computador e videoprojetor. Existem atualmente 7 salas com quadro interativo.
Os alunos estão distribuídos da seguinte forma:
